¿Cómo reclamo a una aerolínea por un vuelo retrasado 4 horas?

Volaba con conexión y un retraso de 4 horas me hizo perder un compromiso importante.

He leído sobre el Reglamento (CE) 261/2004 y las compensaciones, pero no sé si aplica a mi caso ni por dónde empezar la reclamación. ¿Alguien lo ha hecho y me puede orientar con los pasos y los plazos?